Cự Xà Trường Nữ Sinh xoay quanh câu chuyện đầy kịch tính về một cơ sở nuôi rắn bí mật ở ngoại ô Hải Tây. Với việc cho rắn ăn thức ăn có hàm lượng hormone cao, đàn rắn đã dần đột biến và trở nên nguy hiểm. Một ngày nọ, bầy rắn hung dữ thoát ra khỏi lồng và tấn công con người trong cơ sở nuôi rắn. Đồng thời, đám rắn cũng lan truyền vào một trường hàng không gần đó. Trong khi nhà trường chuẩn bị cho buổi lễ tốt nghiệp, sinh viên không hề hay biết về nguy hiểm đang tiếp diễn xung quanh họ và tiếp tục tham gia cuộc thi của trường. Nhưng khi đàn rắn xâm nhập vào các khu vực khác nhau của trường và cắn một số nữ sinh, tiếng la hét và sự hoảng loạn bao trùm ký túc xá. Trong tình huống khẩn cấp này, nhân viên bảo vệ Lưu Siêu đã can đảm giải cứu Lí Mộng Na - một sinh viên bị rắn bao vây. Hai người quyết định thông báo cho giáo viên và sinh viên khác về tình hình nguy hiểm để sơ tán, nhưng lại bị hiệu trưởng ngăn cản. Tuy nhiên, một con rắn đen khổng lồ đã nuốt chửng hiệu trưởng, khiến con người rắn trở thành kẻ săn mồi. Trong cuộc chạy trốn đầy cam go của sinh viên, Lưu Siêu và Lí Mộng Na quyết định dẫn dắt các bạn cùng thoát khỏi nguy hiểm do bầy rắn gây ra.