Sau khi cuộc chiến Chén Thánh lần thứ năm bắt đầu, sự hỗn loạn lan rộng và tạo ra một bức tranh khắc nghiệt hơn. Trong Fate/stay night Movie: Heavens Feel - II. Lost Butterfly, Shirou Emiya không ngừng theo đuổi ước mơ trở thành anh hùng bảo vệ công lý. Anh ta dấn thân vào cuộc truy tìm sự thật về một ánh sáng bí ẩn, cùng với quyết tâm đánh bại kẻ gây ra những vụ giết người đầy bí ẩn.