Nhóc Trùm: Đi Làm Lại (Phần 3) xoay quanh cuộc sống của Nhóc Trùm sau khi bị mất việc tại Tập Đoàn Em Bé. Giờ đây, anh đã trở thành một người làm việc tự do và đã tập hợp một nhóm các đồng bọn lít nhít để thành lập một đội thực địa tạm thời. Cuộc sống mới của Nhóc Trùm chẳng còn êm đềm như trước nữa, bởi sắp tới, anh và đội của mình sẽ phải đối mặt với nhiệm vụ quan trọng không hề dễ dàng. Sự hài hước và phiêu lưu sẽ tiếp tục được tái hiện trong phần tiếp theo này của Nhóc Trùm: Đi Làm Lại.