"Thám Tử Lừng Danh Conan: Câu Chuyện Về Haibara Ai - Chuyến Tàu Sắt Bí Ẩn Kurogane" xoay quanh quá khứ đầy bí ẩn của Ai Haibara và tái hiện lại những khoảnh khắc đầy kịch tính từ phần Chuyến tàu bí ẩn trong anime truyền hình. Trên nền của câu chuyện là sự gặp gỡ đầu tiên giữa Haibara và Conan, bộ phim cũng mang đến cho khán giả những cảnh quay đặc sắc từ Kurogane no Submarine, tạo nên một không gian hấp dẫn và ly kỳ.