Thoát Khỏi Biển Sâu xoay quanh câu chuyện của Quan Tử Huyên, một nhà nghiên cứu sinh vật biển đang tiến hành nghiên cứu về hải dương. Trong phòng thí nghiệm, một con kỳ nhông đầu ngắn đột biến đã tấn công và làm bị thương một người trước khi trốn thoát. Điều này khiến Quan Tử Huyên quyết định điều tra để tìm ra tung tích của cha mình, người đã biến mất trên một hòn đảo hoang vắng. Cùng với những người khác, Quan Tử Huyên lên thuyền và hướng tới hoang đảo. Mỗi thành viên trong nhóm mang theo những tâm sự và bóng ma tâm lý riêng, tạo nên sự căng thẳng và khúc mắc trong cuộc hành trình. Trên đường đi, họ gặp phải một con kỳ nhông khổng lồ bị đột biến, buộc phải chạy trốn và tìm kiếm sự an toàn trên hoang đảo. Trong cuộc phiêu lưu nguy hiểm này, Quan Tử Huyên không chỉ tìm được kỳ nhông biến dị cùng cha mình, mà còn phải đối mặt với những nguy hiểm và thử thách trên hoang đảo. Tuy nhiên, với sự may mắn và sự thông minh của mọi người, họ cuối cùng cũng thoát khỏi biển sâu và trở về an toàn.