Tinh Thúy Tiên Tôn xoay quanh cuộc hành trình đầy phiêu lưu của nhân vật chính Kiều Sâm sau khi nhận được Linh Khí Chi Chủng và khai hoá Linh Thực. Trong chuyến đi này, anh đã gặp gỡ Điền Bích Dao - một dược sư tài năng và con gái của một trưởng lão, cùng với Hoắc Băng Ly - một sát thủ trẻ tuổi thuộc Hắc Long Hội và Phong Vũ Dương - đại tiểu thư của gia tộc Phong. Kiều Sâm không chỉ thu thập linh thạch và đả thông linh mạch, mà còn phát triển linh thực của mình để vượt qua giới hạn con người. Cuối cùng, anh đã thành công trong việc trở thành tuần bổ Lục Phiến Môn trong thành Kiếm Sơn, mang lại niềm hy vọng mới cho các võ sĩ trong vùng đất này.